El proyecto TractoR (Tractography with R) incluye paquetes R para leer, escribir y visualizar imágenes de resonancia magnética almacenadas en formatos de archivo Analyze, NIfTI y DICOM (el soporte DICOM es de solo lectura). También contiene funciones diseñadas específicamente para trabajar con MRI de difusión y tractografía, incluida una implementación estándar del enfoque de tractografía de vecindario para la segmentación del tracto de materia blanca. También se proporciona un script de shell para ejecutar experimentos con TractoR sin interactuar con R. Con TractoR puede

• Convierta archivos DICOM de su escáner MR al formato Analyze / NIfTI.
• Aplique operaciones de procesamiento de imágenes de muchos tipos a datos de imágenes médicas.
• Realice un registro de imágenes lineal y no lineal .
• Procese previamente los datos de difusión por resonancia magnética y calcule métricas de tensor, incluida la anisotropía fraccionada (FA), la difusividad media (DM) y las direcciones principales (consulte procesamiento de difusión ).
• Ejecute la tractografía probabilística utilizando puntos semilla únicos o una o más máscaras.
• Segmente áreas específicas en grupos automáticamente usando tractografía de vecindario (vea el tutorial de PNT ).
• Elimine los tractos falsos positivos utilizando un modelo de variabilidad de la forma del tracto.
• Importe y manipule parcelas anatómicas de datos estructurales .
• Cree, manipule, visualice y descomponga gráficos abstractos que representen la conectividad cerebral , ya sea estructural o funcional.
• Cree gráficos para visualizar cortes de imagen o proyecciones de máxima intensidad.

 

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